Содержание
Скачано: 292, размер: 223.4 KB, дата: 22 Мар. 2021
2021, Том 7 №1 Читать весь выпуск
Скачано: 519, размер: 6.8 MB, дата: 22 Мар. 2021

Оригинальные статьи

Аннотация
Аннотация: Подбор и изучение исходного материала – важный этап селекционного процесса, который необходим для выделения источников хозяйственно ценных признаков. В статье приведены данные сравнительного анализа показателей массы зерна колоса и массы 1000 зерен у сортов яровой мягкой пшеницы различных групп спелости в экологических условиях лесостепи Приобья в 2018–2019 гг. В целом погодные условия изучаемых лет были благоприятными для формирования урожая. Обильное выпадение осадков в июне 2018 г. способствовало увеличению продолжительности периода «всходы – колошение» у рассматриваемого набора сортов, а в 2019 г. дефицит осадков и теплая погода в этот же период вегетации привели к более раннему вступлению растений изучаемых генотипов в фазу колошения. Продолжительность вегетационного периода сортообразцов варьировала от 71 (раннеспелый сорт Новосибирская 16 в 2018 г.) до 104 (среднепоздний сорт Велют в 2018 г.) сут. Между продолжительностью вегетационного периода и температурным режимом отмечена высокая достоверная взаимосвязь (r = 0.91–0.94). Масса зерна колоса у сортов изучаемого набора в 2018 г. варьировала от 0.83 (Новосибирская 16) до 1.55 (Бэль) г, в 2019 г. – от 0.55 (Новосибирская 31) до 1.00 (Обская 2) г. Масса 1000 зерен колебалась в пределах от 26.8 (сорт Тризо, 2018 г.) до 41.5 (сорт Чернява 13, 2018 г.) г. Перспективными для использования в селекции на высокую продуктивность колоса и массу 1000 зерен отмечены генотипы среднераннего сорта Чернява 13 и среднеспелого сорта Бэль.
Ключевые слова: сорт; яровая мягкая пшеница; масса зерна колоса; масса тысячи зерен; вегетационный период.
Благодарности: Экспериментальная работа выполнена при поддержке бюджетного проекта ИЦиГ СО РАН № 0259-2021-0018. Статистическая обработка и оформление результатов проведены при финансовой поддержке гранта РНФ № 16-16-00011-П.
Для цитирования: Агеева Е.В., Леонова И.Н., Лихенко И.Е., Советов В.В. Масса зерна колоса и масса тысячи зерен как признаки продуктивности у сортов яровой мягкой пшеницы разных групп спелости в условиях лесостепи Приобья. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021;7(1):5-11. DOI 10.18699/LettersVJ2021-7-01
Аннотация
Аннотация: Артериальная гипертония – широко распространенное заболевание, снижающее качество жизни и приводящее к фатальным сердечно-сосудистым осложнениям. Симпатоадреналовая система участвует в регуляции артериального давления и патогенезе артериальной гипертонии. Также симпатоадреналовая система является одной из ведущих причин появления реакции на стрессовые события. На сегодняшний день известно, что стресс в совокупности с наследственной предрасположенностью является одним из важных факторов, способствующих развитию артериальной гипертонии в человеческой популяции. В Институте цитологии и генетики СО РАН путем селекции на повышение артериального давления в условиях мягкого эмоционального стресса получены крысы линии НИСАГ (ISIAH), которые характеризуются рядом морфологических и физиологических признаков, свойственных больным артериальной гипертонией. Исследования указывают на повышенную функцию симпатоадреналовой системы у крыс гипертензивной линии НИСАГ. Повышение артериального давления в ответ на стрессовую стимуляцию может также зависеть от генетически обусловленного изменения профиля экспрессии генов адренорецепторов в артериальной стенке. Цель работы – исследовать экспрессию генов альфа1А-, альфа1B-, альфа2А-, бета1- и бета2-адренорецепторов в сосудистой стенке артерии у крыс НИСАГ со стресс-чувствительной артериальной гипертонией. Методом ПЦР в реальном времени показано снижение уровня экспрессии мРНК генов Adra1A и Adra1B адренорецепторов, опосредующих вазоконстрикцию в хвостовой артерии у крыс НИСАГ, что может указывать на компенсаторные изменения экспрессии генов адренорецепторов при артериальной гипертензии. Показано отсутствие экспрессии мРНК гена бета1-адренорецепторов в артериальной стенке у крыс НИСАГ, что свидетельствует о преобладающей роли бета2-адренорецепторов в этом сосуде.
Ключевые слова: альфа1А-адренорецепторы; альфа1B-адренорецепторы; альфа2А-адренорецепторы; бета1-адренорецепторы; бета2-адренорецепторы; ПЦР в реальном времени; артериальные сосуды; артериальная гипертония; крысы НИСАГ. Благодарности: Работа выполнена при поддержке бюджетного проекта № 0259-2021-0016.
Для цитирования: Рязанова М.А., Маркель А.Л. Экспрессия генов адренорецепторов в сосудистой стенке у гипертензивных крыс линии НИСАГ (ISIAH). Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021;7(1):12-16. DOI 10.18699/LettersVJ2021-7-02

Обзоры

Н.В. Шацкая Cеквенирование вироидов
Скачано: 446, размер: 354.2 KB, дата: 22 Мар. 2021
Аннотация
Аннотация: Вироиды представляют собой небольшие патогенные РНК-молекулы длиной от 246 до 467 нуклеотидов, состоящие из одноцепочечной кольцевой РНК, без капсида и последовательностей, кодирующих белок. Вироиды проникают в растения и используют систему хозяина для размножения. Они индуцируют структурные и физиологические изменения в клетках хозяйского организма, которые впоследствии приводят к развитию различных заболеваний. Выявление вироидов непростая задача, с которой довольно успешно справляется NGS-секвенирование. С 2009 г. технологию NGS начали использовать в нескольких областях вирусологии растений, включая секвенирование геномов вироидов, открытие новых видов и определение уже известных. Также NGS-секвенирование может быть использовано в экологии, эпидемиологии, изучении репликации и транскрипции вироидов. В вирусологии растений данная технология наиболее удобна для определения уже известных и новых вироидов в инфицированных растениях. Предполагается, что NGS будет играть значительную роль во многих исследованиях по вирусологии растений и в дальнейшем.
Ключевые слова: секвенирование нового поколения; вироиды; патогены; биобезопасность.
Благодарности: Исследование выполнено при финансовой поддержке РНФ, проект 20-46-07001.
Для цитирования: Шацкая Н.В. Секвенирование вироидов. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021;7(1):17-22. DOI 10.18699/ LettersVJ2021-7-03
Аннотация
Аннотация: Актуальным направлением отечественной селекции ячменя в настоящее время является получение пивоваренных сортов. Поскольку именно от качества используемого сырья в первую очередь зависит качество готового продукта, пивоваренная промышленность предъявляет высокие требования к таким сортам. Одной из главных качественных характеристик пива является его стойкость при хранении, которая определяется временем помутнения пива и влияет, таким образом, на срок годности. Различают биологическое помутнение, образующееся в результате размножения микроорганизмов, и небиологическое (коллоидное), в основе которого лежит взаимодействие белков и полифенолов пива с образованием стабильных нерастворимых комплексов. Традиционная селекция пивоваренных сортов направлена на снижение содержания белка, однако, как показал мировой опыт, высококачественные сорта можно также получить с помощью снижения содержания в зерне полифенольных соединений. В обзоре суммированы данные о синтезе главных полифенольных компонентов коллоидного помутнения пива – проантоцианидинов, которые легли в основу получения пивоваренных беспроантоцианидиновых сортов ячменя. Реализованный в мировой практике опыт может быть полезен при разработке отечественных селекционных программ, направленных на создание высококачественных пивоваренных сортов ячменя.
Ключевые слова: конденсированные танины; индуцированный мутагенез; пиво; флавоноиды; полифенолы.
Благодарности: Знакомство автора с коллекцией безантоциановых/беcпроантоцианидиновых мутантов ячменя в Лундском университете (Лунд, Швеция) поддержано грантом Swedish Institute Visby Programme No. 25896/2018. Публикация подготовлена в рамках работы по проекту Минобрнауки России «Курчатовский центр геномных исследований мирового уровня» № 075-15- 2019-1662.
Для цитирования: Шоева О.Ю. Мировой опыт создания пивоваренных сортов ячменя на основе беспроантоцианидиновых мутантов. Письма в Вавиловскийжурнал генетики и селекции. 2021;7(1):23-33. DOI 10.18699/LettersVJ2021-7-04

Методы

Аннотация
Аннотация: Развитие методов секвенирования ДНК нового поколения стало одним из основных двигателей прогресса в биологических исследованиях последних лет. Эти методы позволили активно применять ДНК-баркодирование для решения широкого спектра биологических задач. Ключевым этапом работ с баркодированными молекулами ДНК является создание библиотеки баркодированных плазмид. Данная статья посвящена описанию методики с использованием клонирования по Гибсону. Клонирование методом Гибсона позволяет создавать сложные генетические конструкции, состоящие из большого числа фрагментов. Кроме того, этот метод допускает использование олигонуклеотидов с вырожденными позициями, что удобно для разработки баркодированных библиотек. Применение данной методики позволяет получать библиотеки с высоким разнообразием (более 105) баркодированных молекул. В статье описаны основные этапы создания баркодированной библиотеки, в частности рассмотрены принципы дизайна последовательностей баркодированных олигонуклеотидов и особенности сборки библиотек методом Гибсона. Приведены условия очистки реакционной смеси на магнитных частицах и оптимальные параметры электропорации созданных конструкций в клетки бактерий. Описаны протоколы наращивания культур бактериальных клонов, выделения плазмидной ДНК и очистки ее от молекул вектора, не несущих вставки, с помощью дополнительного гидролиза эндонуклеазами рестрикции и обработки препарата плазмидной ДНК экзонуклеазой Plasmid-Safe. Важным этапом работы являются характеристика полученного препарата и оценка разнообразия баркодированных молекул в библиотеке. В статье также представлено описание подготовки библиотеки для последующего секвенирования на платформе Illumina без использования амплификации. Кроме того, приведен алгоритм биоинформатического анализа данных секвенирования для оценки разнообразия баркодированных молекул. Полученная таким способом библиотека может быть использована в исследованиях для анализа индивидуальных молекул ДНК. Представленная в настоящем исследовании библиотека будет применена для изучения рекомбинации в ранних эмбрионах мыши.
Ключевые слова: ДНК-баркодирование; плазмидная библиотека; клонирование по Гибсону.
Благодарности: Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта № 20-34-70087.
Для цитирования: Смирнов А.В., Юнусова А.М., Муравьева А.А., Валеев Э.C., Фишман В.C., Баттулин Н.Р. Создание библиотек баркодированных плазмид с помощью метода клонирования по Гибсону. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021;7(1):34-45. DOI 10.18699/LettersVJ2021-7-05

Мемориальные статьи

Аннотация
Для цитирования: Гончаров Н.П., Моргунов А.И., Шаманин В.П., Цыганков В.И., Есимбекова М.А., Лоскутов И.Г., Гузман К., Шеври П.P., Эль-Солх М. Памяти профессора Айгуль Изтелеуовны Абугалиевой (1959–2020). Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021;7(1):46-65. DOI 10.18699/LettersVJ2021-7-06